1种基于信息理论的新分子序列度量法

摘要：

传统的方法度量序列之间的距离需要序列比对,使一些主观因素破坏数据的原始状态,导致计算结果因人而异.本文拟介绍一些基于信息理论的度量法,提出1种类似的新度量法,建立数学依据.这些度量法度量序列之间的距离不需要序列比对,没有主观因素干涉.同时,选取了20种胎生哺乳动物的线粒体全基因序列,分别使用这些度量法计算出他们的距离,再利用NEIGHBOR法构建系统树.由比较结果看来,新方法用较少时间构建的系统树完全不逊色于以往的方法.这为研究分子序列的差异性提供了1种新方法.

关键词：信息熵、度量法、系统树

所属期刊栏目：26

分类号：O6;TP393;TQ015.9;O6-39

资助基金：国家自然科学基金资助项目10571019:数学方法在分子生物学中的应用

在线出版日期：2010-01-19（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共5页

页码：1380-1384