基于残基序列信息的蛋白质相互作用位点预测

摘要：

蛋白质相瓦作用位点在细胞进程中有着非常重要的作用.尽管利用高通量方法发现蛋白质相瓦作用位点取得很大的成功,仍需要计算方法辅助预测实验中的相互作用位点.本文提出了基于残基序列谱、进化率和疏水性的预测异源蛋白质复合物作用位点的两种向量表示方法并以支持向量机实现预测.其中,提出新的向量表示法取得更好的预测性能.文中的数据集由66个异源复合物蛋白质链组成.

关键词：支持向量机、蛋白质相互作用位点、序列谱、进化率、疏水性、向量表示

所属期刊栏目：25

分类号：Q811.4;O235(生物工程学(生物技术))

资助基金：the National Natural Science Foundation of China30571059;the National High-Tech Research and Develop-ment Program of China2006AA022190

在线出版日期：2008-12-10（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共5页

页码：649-653