基于最大熵模型预测蛋白质结构的分类

摘要：

基于最大熵模型,构建一种简单的预测蛋白质序列结构分类的算法.不同性质的氨基酸组合,在特定结构的蛋白质二级结构中,出现的频率不同,通过在模体数据库Prosite中查找蛋白质序列匹配的模体,以10种氨基酸组合在序列中出现的频率,表示蛋白质序列的特征,构建相应的结构分类预测模型.最大熵模型用来确定蛋白质结构分类预测模型的参数.以自身一致性和Jackknife测试方法验证分类模型的准确性.结果表明新构建的方法简单、准确,综合性能优于一般的预测方法.

关键词：蛋白质、结构类预测、最大熵模型、模体

所属期刊栏目：24

分类号：Q51(蛋白质)

在线出版日期：2008-03-03（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共3页

页码：1532-1534