RS-GA-SVM方法在真核生物DNA翻译起始位点识别中的应用

摘要：

联合运用粗糙集(RS)理论-遗传算法(GA)-支持向量机(SVM)方法研究真核生物翻译起始位点(TIS)的识别.采用RST和GA算法从原始变量中筛选出TIS周围高度保守的位点构成变量集,再采用SVM识别真核生物的TIS.研究处理获得的结果为:采用RS-GA-SVM方法对于真核生物TIS的总识别正确率CP达92.00%,相关系数CO为0.8327;而直接使用SVM方法处理原始变量数据的总识别正确率CP和CO仅为89.87%和0.7885.研究表明,采用RS-GA算法对变量进行筛选,起到了去除冗余信息,提高识别效果的作用,同时也减少了计算工作量.

关键词：粗糙集理论、遗传算法、支持向量机、翻译起始位点、识别

所属期刊栏目：24

分类号：Q617;TP391(理论生物物理学)

在线出版日期：2007-09-10（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共5页

页码：794-798