分子动力学模拟蛋白质吸附过程中势能函数计算的分组简化

摘要：

分子水平上理解蛋白质吸附的机理,是目前蛋白质工程、生物材料和生物医学领域中一个基本问题.本文根据蛋白质分子结构的特点,采用刚体模型,在NVT条件下,对聚十赖氨酸分子在固液界面上的吸附过程进行了分子动力学模拟.在计算过程中,通过对原胞内原子进行适当分组的方法改进,以求进一步提高对势能函数的计算速度.研究结果表明,适当分组的方法可以简化分子动力学模拟的计算过程,加快计算速度,而模拟结果反映了吸附过程中蛋白质分子构象变化过程.

关键词：分子动力学模拟、蛋白质吸附、势能函数、分组简化

所属期刊栏目：22

分类号：TQ937;Q71(其他化学工业)

资助基金：国家自然科学基金29806010

在线出版日期：2005-11-24（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共3页

页码：389-391