tPSODock:基于化学得分函数和两层粒子群算法的计算机分子对接程序

摘要：

药物分子对接是计算机辅助药物设计的主要方法之一.利用化学得分函数(Chemscore)作为能量函数,以及将一种新的优化算法-两层粒子群算法作为搜索算法,得到了一种新的计算机分子对接程序:tPSODock.利用tPSODock计算了100个蛋白质-配体的复合物,并且与Consdock和Autodock 3.0计算结果进行了对比,结果显示88%的计算结果RMSD小于2.0A,优于Consdock以及Autodock的计算结果.说明tPSODock在是一种高效的分子对接软件,可以用于大规模数据库的筛选工作,适合新药的开发和研制.

关键词：分子对接、化学得分函数(Chemscore)、粒子群算法、两层粒子群算法、tPSODock

所属期刊栏目：22

分类号：O6-04

资助基金：国家自然科学基金20275026

在线出版日期：2005-11-24（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共5页

页码：339-343