脯氨酸肽键数据集的构建

摘要：

由分辨率＜0.25nm,同一性(identity)＜30%的2401条肽链中计算提取了全部顺式与反式脯氨酸肽键的位置,数目分别为1221个与26401个,从而建立了一个较大规模的脯氨酸肽键数据集.统计分析了该数据集的基本特征:肽键N端残基的分布、N端残基的二面角统计、在二级结构中的分布情况、顺式肽键在脯氨酸肽键中所占比例.此数据集对于进一步研究顺反X-Pro肽键的结构、与氨基酸序列之间的关系,以及肽链折叠动力学具有重要作用.

关键词：脯氨酸、肽键、数据集、顺式、反式

所属期刊栏目：20

分类号：Q61(理论生物物理学)

资助基金：教育部重点实验室基金200102

在线出版日期：2004-04-09（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共8页

页码：805-812