基于自组装模型的最大团问题DNA计算算法

摘要：

DNA计算在解决NP完全问题时,有着传统图灵机无法比拟的优势.但是随着DNA计算研究的不断深入,传统DNA计算模型显现出杂交错误率和生化操作复杂性过高的缺点.如何提高DNA计算结果的准确性在DNA计算研究中日显重要.针对NP完全的最大团问题,引入DNA自组装模型,提出了一种求解最大团问题的DNA计算算法.算法通过减少实验的操作步骤数,以降低生化解的错误率,给出了DNA分子的编码方案及结果检测的实验方法.算法设计的tiles种类为(O)(n+|E|),生化操作复杂性为(o)(1),其中n为图的顶点数,|E|为边数.与求解最大团问题的其他DNA算法的对比分析表明,本算法不仅明显提高了生化解的准确性,且算法的生化实验复杂度低,具有良好的实验操作性.

关键词：DNA计算、自组装、并行计算、NP完全问题、最大团问题

所属期刊栏目：50

分类号：TP301.6(计算技术、计算机技术)

资助基金：国家自然科学基金项目61133005,61070057,61202109,61173013;国家科技支撑计划基金项目2012BAH09B02;湖南省杰出青年基金项目12JJ011

在线出版日期：2013-04-27（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共10页

页码：666-675