肿瘤突变印迹的求解算法比较

摘要：

细胞受到致癌因子刺激时引起突变,突变过程使基因组发生具有一定模式的改变,称为突变印迹.突变印迹分析是阐明致癌因子的致癌机制及驱动癌症发展的一项重要任务,将为肿瘤早期诊断和个体化治疗提供新的依据和选择.下一代测序技术的突破和发展使得海量体细胞突变被识别,从而使从大规模基因组中挖掘突变印迹成为可能.本文详细解释了突变印迹识别问题的数学模型,介绍了求解方法和重要参数,系统全面地比较了主流算法和软件,指明了突变印迹提取的注意事项.最后,对该领域的未来发展趋势进行了探讨.

关键词：体细胞突变;突变印迹;非负矩阵分解;期望最大化;线性回归

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资助基金：中国科学院战略性先导科技专项B类XDB38040100

在线出版日期：2021-12-21（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共9页

页码：46-54