肿瘤微卫星不稳定检测方法综述
微卫星是广泛分布在真核生物基因组中的短串联重复序列.微卫星不稳定(Microsatellite Instability,MSI)是指由DNA错配修复系统故障引起的微卫星区域重复序列插入或缺失的现象.微卫星不稳定的检测对于肿瘤的早期诊断以及预后判断等具有重要的意义.临床上采用MSI-PCR以及MMR-IHC的实验方法检测MSI,随着下一代测序技术的发展,基于高通量测序数据的MSI检测方法及软件逐渐涌现.本文将从生物学实验方法和计算方法两个角度对当前的MSI检测方法进行介绍并讨论分析这些方法的优势及局限.
肿瘤、微卫星不稳定、MSI-PCR、MMR-IHC、统计方法、机器学习
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国家重点研发计划2016YFC0503607, 2016YFB0201901;国家自然科学基金31771466;青海省科技成果转化专项2016-SF-127;中国科学院信息化专项XXH13504-08;中国科学院战略性先导科技专项 A 类XDA12000000;中国科学院"百人计划"
2018-11-02（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
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