Hadoop框架下节点重要性算法实现蛋白质功能预测

摘要：

论文从蛋白质序列数据的角度出发，通过序列相似度循环匹配构造蛋白质网络，并且通过网络节点重要性排序算法预测蛋白质功能。以节点重要性重要性作为研究对象，在蛋白质网络应用节点重要性算法 PageRank计算网络中蛋白质节点PR值，在Hadoop平台上进行开发实现功能预测的并行计算，减小运行时间。最后通过准确率，召回率以及F1-measure三个指标来衡量结果，并对比传统的功能预测方法，验证结果的有效性。

关键词：蛋白质序列、功能预测、循环匹配、节点重要性、Hadoop平台

所属期刊栏目：25

分类号：TN9;TP3

资助基金：福建省自然科学基金2014J01220;三明学院科研基金B201201/G;福建省教育厅科技基金JB13187,JA15463

在线出版日期：2016-06-16（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共6页

页码：77-82