基于朴素贝叶斯分类器的蛋白质界面残基识别

摘要：

蛋白质相互作用中界面残基的识别在药物设计与生物体的新陈代谢等方面有着广泛应用.基于朴素贝叶斯分类器对属性条件独立性的要求,构建了由蛋白质序列谱和溶剂可及表面积组成的蛋白质相互作用特征模型.在一个具有代表性的蛋白质异源复合物组成的数据集中取得了68.1%的准确率、0.201的相关系数、40.2%的特异度和49.9%的灵敏度,取得了比其他方法更优的结果,且远优于随机的实验结果.通过一个三维可视化的结果更好地验证了方法的有效性.

关键词：朴素贝叶斯分类器、蛋白质相互作用界面、序列谱、残基溶剂可及表面积

所属期刊栏目：3

分类号：TP39(计算技术、计算机技术)

资助基金：The Projects of Provincial Natural Scientific Fund from the Bureau of Education of Anhui Province No.KJ20078066,KJ2007A087;the Science and Research Fund from the Bureau of Anhui Province for Young Teachers No.2007jq1140

在线出版日期：2009-06-17（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共10页

页码：293-302