蛋白质关系网络可视化系统的研究与实现

摘要：

蛋白质关系网络的研究在生物医学领域中已成为一个热点.研究者通过对蛋白质关系网络进行分析和聚类,能够发现其中的复合体,进一步理解细胞组织原理.在对关系网络进行分析的过程中,将网络拓扑显示为图形,以直观地表示出关系网络的结构,便于对比聚类方法,辅助关系网络的研究.利用网络建模与可视化工具包JUNG设计并实现了一个蛋白质关系网络可视化系统,它能够解析多种格式的蛋白质关系网络数据,集成了几种有效的图聚类算法,并实现了一种基于蛋白质功能标注的发现复合体的聚类算法.用户能够通过二维网络视图方便地观察原始网络和聚类后的结果.

关键词：蛋白质关系网络、网络可视化、图聚类、JUNG工具包

所属期刊栏目：38

分类号：TP391(计算技术、计算机技术)

资助基金：国家自然科学基金60673039,60973068,61070098;国家社科基金08BTQ025;国家863高科技计划2006AA012151;教育部留学回国人员科研启动基金和高等学校博士学科点专项科研基金20090041110002

在线出版日期：2012-03-16（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共4页

页码：232-235