利用计算方法识别定义内含子保留的基因组特征

摘要：

超过90％的人基因都存在选择性剪接.正确识别不同的选择性剪接模式对深刻理解基因剪接调控机制具有重要意义.内含子保留是一种较为常见的基因剪接模式.从基因组序列本身出发,利用计算方法识别定义内含子保留的各种基因组特征,抽取统计意义上显著差异的特征,利用三种分类方法( SVM,NN,NB)对这些基因组特征进行了分类预测验证实验,保留内含子的平均预测精度达到70％,整体平均精度达到90％,取得了良好效果.研究方法也可应用于其他基因剪接模式的研究.

关键词：基因剪接、内含子保留、基因组特征

所属期刊栏目：48

分类号：TP311(计算技术、计算机技术)

资助基金：安徽省自然科学基金1208085QF120;安徽大学博士科研启动基金33190013;国家自然科学基金面上项目61173187

在线出版日期：2013-01-05（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共6页

页码：36-41