基于特征综合的启动子识别方法

摘要：

针对真核生物启动子识别的高假阳性现状,提出了一种基于特征综合的真核启动子识别方法.通过提取人类启动子核苷酸联体统计信息作为特征,并使用主成分分析法进行主元提取.将10维主成分特征与2维CpG岛特征进行特征综合,共同作为BP神经网络的输入来识别启动子.对人类基因序列启动子的预测结果表明,不但有效地减小了假阳性,而且具有较好的敏感性和特异性.

关键词：启动子、启动子识别、主成分分析、CpG岛、反向传播(BP)神经网络

所属期刊栏目：48

分类号：TP319.4(计算技术、计算机技术)

资助基金：教育部留学回国人员科研启动基金;中央高校基本科研业务费专项资金自由探索项目HEUCF100604

在线出版日期：2012-06-26（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共4页

页码：201-204