10.3778/j.issn.1002-8331.2011.09.002
随机走步软聚类识别蛋白质网交叠功能模块
认定蛋白质交互网中的功能模块对于理解细胞的组织结构,处理过程及其功能都是至关重要的.由于一个蛋白质可能具有多重功能因此蛋白质功能模块可能会相互交叠.然而,目前已有的一些识别功能模块的软聚类算法有如下两个缺陷:一是一些算法需要阈值来截断聚类;二是有些算法需要预设聚类数目.为了克服这两个缺陷,提出了随机走步软聚类识别算法来认定蛋白质交互网中的交叠功能模块.实验结果表明该算法在无需任何参数的情况下能发现一些重要的交叠功能模块.
蛋白质交互网、功能模块、随机走步
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TP399(计算技术、计算机技术)
国家重点基础研究发展规划973the National Grand Fundamental Research 973 Program of China under Grant 2009918501
2011-09-05(万方平台首次上网日期,不代表论文的发表时间)
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