从基因芯片数据快速有效地挖掘共调控基因

摘要：

针对基因芯片数据高噪音、列(基因)数比行(实验条件)数多几个数量级的特殊性,为了进一步提高从基因芯片数据挖掘共调控基因的时间效率和挖掘结果的有效性,首先根据所有两两基因对之间的Pearson相关系数对原始完整数据集进行分组,然后使用列(基因)枚举方法对各组数据分别进行闭合频繁模式挖掘,并对活化和抑制共调控关系的挖掘分别进行处理.实验结果证明:算法快速有效地挖掘出了两种共调控基因.

关键词：基因芯片数据、共调控基因、Pearson相关系数、闭合频繁模式

所属期刊栏目：46

分类号：TP311(计算技术、计算机技术)

资助基金：陕西省自然科学基金the Natural Science Foundation of Shaanxi Province of China under Grant 2007F27

在线出版日期：2010-05-17（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共5页

页码：33-37