基于复杂网络理论的PPI网络拓扑分析

摘要：

蛋白质相互作用在生命活动中起核心作用,由蛋白质相互作用构成的PPI网络的拓扑特性分析是后基因组时代最重要的研究课题之一.应用复杂网络理论对DIP数据库中7个物种的8个PPI网络的拓扑结构进行分析与研究.分析结果表明,这些PPI网络具有较小的平均路径长度和较高的聚集系数,其度分布服从幂规律,即p(k)=ak',其中r大于1小于3,a近似等于1±0.5,表现出典型的无标度性,并具有高的异质性.其中平均度大于3.5的5个PPI网络对随机删除不超过10%的顶点都具有很好的鲁棒性,但对有选择的删除2%的高度顶点就开始表现出极弱的抗攻击性.

关键词：生物信息学、蛋白质相互作用网络、复杂网络、网络拓扑

所属期刊栏目：44

分类号：TP393(计算技术、计算机技术)

资助基金：国家自然科学基金60433020;教育部新世纪优秀人才支持计划NCET-05-0683;教育部长江学者和创新团队发展计划IRT0661

在线出版日期：2008-05-22（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共4页

页码：20-22,44