蛋白质表面模拟算法研究

摘要：

蛋白质表面在进行蛋白质相互作用及蛋白质对接等方面有着非常重要的作用.根据蛋白质三维结构数据的特点,首先按照蛋白质的三维几何特征设计了一种提取蛋白质表面原子的几何算法PSAGA.在提取出的表面原子基础上,引用球函数具有的旋转不变性的特点,进行蛋白质表面形状的模拟,模拟出的蛋白质表面可以有效克服蛋白质在空间变换过程中需要不停进行重新计算表面问题,从而有效地提高了计算效率.实验结果验证了所用方法的准确性.

关键词：蛋白质表面、探针球、珠函数

所属期刊栏目：43

分类号：TP181(自动化基础理论)

资助基金：安徽省高校青年教师资助计划2007jql140;安徽省自然科学基金KJ2007B239

在线出版日期：2008-03-03（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共3页

页码：92-94