基于数据挖掘技术的蛋白质结构分类的研究

摘要：

论文选择蛋白质二级结构数据为研究对象,应用数据挖掘技术和机器学习中的动态规划理论进行蛋白质结构分类.介绍了一种新的蛋白质结构分类方法--PSSC,该方法的核心算法是STRIDE算法和ISSA算法,关键性步骤是创建分类模型,该分类模型包括构建CATH分类树、计算蛋白质结构相似度、利用统计方法制定分类标准三步.在对蛋白质结构进行四个层次的分类中,应用已有的RMSD、Z-Score结构比对算法和论文新提出的ISSA结构比对算法获得分类参数.最后,介绍我们所开发的PSSC分类软件,并指出需要完善之处和解决方案.

关键词：蛋白质结构、分类、数据挖掘、PSSC、STRIDE、ISSA

所属期刊栏目：42

分类号：TP39(计算技术、计算机技术)

资助基金：国家自然科学基金60374070;广东省自然科学基金031903

在线出版日期：2006-11-07（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共4页

页码：155-157,170