应用改进型遗传算法进行药物分子对接设计

摘要：

文章建立了一种约束优化的演化模型,并构造出求解此模型的多种群空间收缩遗传算法,将信息熵概念引入进化过程,控制各种群寻优搜索时解空间的收缩.该算法用种群的多样性避免遗传进化的早熟现象,并以空间收缩尺度作为停机判椐,有效地控制了算法的收敛.利用基于小种群的多种群进化策略,在保证种群多样性的前提下,极大程度地减少了计算量,提高了计算效率.数值算例表明,熵的介入增强了随机搜索类进化算法的寻优目的性,使收敛过程平稳且迅速.算例表明此算法能有效的应用于药物分子对接设计.

关键词：小种群遗传算法、信息熵、药物设计、分子对接

所属期刊栏目：39

分类号：TP18(自动化基础理论)

资助基金：国家自然科学基金10272030;国家重点基础研究发展计划973计划19990328

在线出版日期：2004-02-27（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共4页

页码：31-33,89