10.16208/j.issn1000-7024.2018.11.021
改进的无需比对的DNA序列分类算法
针对现有方法容易导致因序列重排或碱基丢失而影响分类精度、敏感度和特异性等问题,提出一种改进的无需比对DNA序列分类算法.通过对不等长的DNA序列功率谱采取匹配加权值的方法提取特征值,将任意长度的DNA序列映射成等长的特征向量,准确计算不同类DNA序列特征向量之间的距离,利用计算得到的距离值,通过K-NN(K-Nearest Neighbor)分类器完成DNA序列分类.在核小体DNA序列数据集CE、DM和HM上的实验结果表明,与已有的同类方法相比,该算法总体上获得了较高的分类精度、敏感度和特异性.
DNA序列、分类、无需比对、特征提取、离散傅里叶变换
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TP338.6;TP301.6(计算技术、计算机技术)
广西自然科学基金项目2014GXNSFAA118396
2019-01-22(万方平台首次上网日期,不代表论文的发表时间)
共6页
3415-3419,3455