用拓扑和语义信息计算熵值的PPI网络聚类

摘要：

采用较大相关种子簇方法优化种子选择，获得更佳的起始聚类，在种子生长过程中忽略蛋白质交互网络（PPI网络）中关联较小的边，筛选掉基因术语相似度较低关系连接，提升算法的效率与聚类结果的精确度，通过融合拓扑结构和语义相似度优化计算熵值，提高熵值代表的信息量，获得更佳的PPI网络聚类结果。实验结果表明，与已有算法相比，该方法能获得更大 f‐sco re的聚类结果，聚类时间更短。

关键词：蛋白质交互网络、聚类、熵、语义相似度、拓扑结构

所属期刊栏目：37

分类号：TP301.6(计算技术、计算机技术)

资助基金：国家自然科学基金项目61462005；广西自然科学基金项目2014GXNSFAA118396；广西研究生教育创新计划基金项目YCSZ2014034；广西教育厅-广西大学博士点建设基金项目P11900119

在线出版日期：2016-04-22（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共5页

页码：757-761