海洋模式FVCOM2.6并行计算性能TAU分析

摘要：

本文利用并行程序分析软件Tuning and Analysis Utilities(TAU),对基于Message Passing Interface(MPI)的海洋环流模式Finite-Volume Coastal Ocean Model(FVCOM) 2.6版本进行并行性能分析.在Linux集群(Intel Xeon CPU E5450,10G InfiniBand)上,使用不同进程数分别对低分辨率(网格节点数为2 108和10 378)、高分辨率(网格节点数为15 347和26 033)的深沪湾潮汐算例进行测试.结果表明,模式单进程运行时,平流项子程序所占运行时间比例较大；模式多进程运行时,通过比较不同算例的加速比,发现算例分辨率对模式的并行性能有较大影响.在本次测试硬件条件下,算例存在某一最佳进程数,低分辨率为32,高分辨率为64,最佳进程数随分辨率增高而增高.到达最佳进程数后,随着进程数增加,模式运行时间反而增加.TAU分析表明,主要是由于MPI_Waitany程序时间比例增加以致阻塞时间占模式运算总时间的比例增大,从而为FVCOM并行性能进一步改善提供参考.

关键词：FVCOM、TAU、性能分析、并行计算

所属期刊栏目：33

分类号：TP301(计算技术、计算机技术)

资助基金：上海市高校优秀青年教师专项基金B-8101-09-0237;上海市科委重点项目09320503700;上海市教委高校第5期海洋环境J.程重点学科建设项HJ50702

在线出版日期：2012-04-20（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共7页

页码：87-93