基于多特征尺度的大肠杆菌启动子预测

摘要：

本文对实验证实的741条大肠杆菌Sigma70启动子的序列进行预测研究.首先,基于RNA聚合酶与DNA的相互作用,利用位置打分函数对序列中的保守位点进行了衡量;然后,根据启动子的序列特征,利用离散性指标对序列中不同的碱基信息含量进行测量;最后,利用多元非线性判别分析实现了对大肠杆菌启动子的预测.10折叠交叉检验结果显示,总体预测精度达到85%以上.与其它算法比较结果显示,我们开发的这一算法能够更好地预测大肠杆菌启动子.

关键词：大肠杆菌启动子、位置关联打分函数、多样性指标、修正的马氏判别式

所属期刊栏目：32

分类号：Q61(理论生物物理学)

资助基金：内蒙古大学青年科学基金资助项目ND0810;电子科技大学科研启动费资助项目

在线出版日期：2010-11-25（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共4页

页码：148-151