基于语义数据的药物网络模型构建与分析

摘要：

针对传统生物数据分析方法无法高效处理规模不断增大的生物语义数据集的现状,将基于属性共现的节点相似度算法应用于ChEMBL数据集,构建基于药物天然产物-活性的二部图模型,应用Graphlab框架计算基于活性特征的药物天然产物相似度,并对相似度较高的药物天然产物进行活性推荐.实验结果表明,该方法能有效利用生物数据集的语义信息发现药物天然产物潜在的活性特征,从而指导药物研发早期的活性探测以及药物靶标的发现和选择过程.

关键词：语义数据、ChEMBL数据集、活性、Graphlab并行计算、节点相似度算法

所属期刊栏目：42

分类号：TP311(计算技术、计算机技术)

资助基金：国家自然科学基金资助项目61173155,61373035;国家“863”计划基金资助项目2007AA01Z130,2013AA013204

在线出版日期：2016-08-19（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共7页

页码：31-36,42