基于Hadoop的化合物生物活性分析系统

摘要：

通过药物虚拟筛选,发现在具有生物活性化合物过程中,存在小分子结构相似性比较计算繁杂等问题.为此,结合MapReduce 模型,提出一种基于Hadoop的并行计算模型处理方法,并通过Hadoop工具予以实现.同时根据Hadoop分区算法不均匀、容错功能存在重复计算等问题对该方法进行改进.实验结果表明,该方法平均加速效率达到0.91,具有较好的可靠性和扩展性.

关键词：生物活性、生物信息学、并行计算、可扩展性、数据库、Hadoop框架

所属期刊栏目：38

分类号：TP311(计算技术、计算机技术)

资助基金：国家“863”计划基金资助项目2009AA02Z308

在线出版日期：2012-10-29（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共3页

页码：48-50