蛋白质结构预测聚类算法的评估

摘要：

在7个数据集上对3种不同聚类算法与3种不同相似性度最标准的多种组合进行实验,以评估这些因素对聚类性能的影响.为便于确定聚类参数,提出一种针对蛋白质结构预测的聚类中心选择算法.实验结果表明,在3种相似性度量标准中,RMSD对于聚类的效果最好,而在3种聚类算法中,SPICKER性能最优,其次是AP聚类算法.

关键词：蛋白质结构预测、候选结构、聚类算法、相似性度量、评估

所属期刊栏目：37

分类号：TP311(计算技术、计算机技术)

资助基金：国家自然科学基金资助项目60970055

在线出版日期：2011-04-13（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共4页

页码：24-27