InsPecT的2种并行优化方案

摘要：

InsPecT软件能通过盲搜索对蛋白质翻译后修饰进行鉴定,但其计算时间和复杂度较高.针对该问题分别采用对等模式和主从模式实现2种并行优化方案.比较结果表明,以主从模式并行的InsPecT软件通过动态数据分配和主从处理器间的及时响应,维持了更优的负载平衡,其加速效果较明显.

关键词：蛋白质翻译后修饰、InsPecT软件、盲搜索、对等模式、主从模式

所属期刊栏目：36

分类号：N945.15(系统科学)

资助基金：国家"863"计划基金资助项目"面向科学研究的超级计算服务环境"2006AA01A116;国家自然科学基金资助项目"当代并行机的并行算法应用基础研究"60533020;国家自然科学基金资助项目"特征信息发现的并行算法及实现研究"60673064;中国科学院知识创新工程基金资助重大项目"面向蛋白质科学的高性能计算研究"KGGX1-YW-13

在线出版日期：2010-05-24（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共3页

页码：100-101,104