基于遗传算法的蛋白质质谱数据特征选择

摘要：

针对蛋白质质谱数据在降维、分类及生物标记物识别过程中存在的问题,提出一种基于遗传算法的特征选择方法,介绍几种常用的相关策略,包括基于排列和精英保留的随机通用采样选择策略和基于自适应变异率的均匀变异策略,给出2个适应度函数--封装器函数与多变元筛选器函数,将它们引入遗传算法中,并进行性能测试与比较.实验结果表明,基于封装器的遗传算法性能优于其他特征选择算法,而基于多变元筛选器的遗传算法性能优于单变元筛选器算法.

关键词：质谱、遗传算法、特征选择

所属期刊栏目：35

分类号：TP311.52(计算技术、计算机技术)

资助基金：山东省高等学校优秀骨干教师国际合作培养基金;山东轻工业学院博士启动基金资助项目12041653

在线出版日期：2009-12-04（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共4页

页码：192-194,197