基于GM(2,1)的亚细胞定位预测

摘要：

对于蛋白质氨基酸序列,使用GM(2,1)模型的参数作为伪氨基酸成分,加上各氨基酸在序列中所占比例,构成蛋白质的灰色伪氨基酸成分表示.利用扩大协方差算法预测亚细胞定位,开发基于该方法的亚细胞定位预测服务器.在相同的数据集上,对比实验结果显示,该预测服务器在总体预测率上达到77.6%,比其他预测方法优越.相关的研究拓展了灰色理论在生物信息学上的应用.

关键词：亚细胞定位、灰色模型GM(2,1)、灰色伪氨基酸成分、亚细胞定位预测服务器

所属期刊栏目：35

分类号：TP392(计算技术、计算机技术)

资助基金：国家自然科学基金资助项目60661003;江西省自然科学基金资助项目0611060;江西省青年科学家井岗之星培养计划基金

在线出版日期：2009-05-20（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共3页

页码：225-226,229