DNA片段拼接中的预归并重复序列屏蔽方法

摘要：

针对DNA片段拼接中的重复序列识别及屏蔽问题,提出一种预归并重复序列屏蔽方法.在片段拼接前通过扫描子串标识出可能存在重叠关系的shotgun片段,利用子串归并该相关片段,标识出重复序列的位置信息,达到屏蔽的目的.计算机模拟分析表明,该方法识别重复序列的错误率低,通过预归并有效缩减了shotgun集合的规模,降低了拼接时的计算复杂度.

关键词：片段拼接、预归并、重复序列、屏蔽

所属期刊栏目：35

分类号：N945(系统科学)

在线出版日期：2009-04-08（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共3页

页码：88-90