面向比较基因组学的可视化方法综述

摘要：

利用可视分析技术对基因组学数据进行比较,能够高效地感知基因序列与属性背后的多组学功能结构,深度挖掘保守与变异对基因组亲缘关系的影响,对数据密集型的比较基因组学知识发现具有重要意义.综述近年来国内外比较基因组学可视分析的相关研究,首先简述基因组学序列及衍生信息的数据结构和分析任务,将基因组坐标空间布局分为纵向离散、横向连续和径向嵌套3类,比较归纳各类空间映射方法的研究现状和优缺点;然后针对基因组比较关系进行抽象,总结适用于交互关联和家族层次2种主要比较关系的可视化方法;最后指出面向比较基因组学的可视化方法在数据融合、交互联动、通用框架中面临的挑战和机遇.

关键词：比较基因组学、基因空间布局、比较关系、可视化

所属期刊栏目：34

分类号：TP391.41(计算技术、计算机技术)

资助基金：国家科技重大专项;国家自然科学基金

在线出版日期：2022-06-29（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共17页

页码：852-868