RNA二级结构预测优化模型的仿真分析

摘要：

由于RNA的结构与功能密切相关,可通过预测RNA的结构可以深入挖掘其功能,研究分子生物的重要性能.传统的预测方法主要是通过RNA的功能特征进行预测,在针对海量RNA序列时,RNA分子降解速度快导致功能特征多样化,增加了计算的复杂性,导致预测准确率低.提出改进模拟淬火算法的RNA二级结构的预测方法.利用适应度函数获得初始的RNA结构,采用遗传算法获得其它形式的结构,并通过模拟淬火算法不断调整能量.引入遗传算法的变异和选择获得RNA的最优结构.根据适应度函数越小,种群越优,RNA结构能量越低,结构越稳定的原理确定最优RNA的二级结构.仿真结果表明,改进算法能够提高RNA二级结构预测的准确率.

关键词：二级结构、预测、模拟淬火

所属期刊栏目：33

分类号：TP391(计算技术、计算机技术)

资助基金：2015年度广西民族大学校级科研项目2015MDYB016

在线出版日期：2016-10-10（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共4页

页码：323-326