细胞信号转导网络的全局灵敏度分析

摘要：

灵敏度分析是定性定量研究系统生物学模型不确定性的主要方法,可以有效确定主导参数,减小模型不确定性,提高优化效率.然而如何快速有效地评估参数灵敏度现已成为系统生物学模型优化的难题.针对传统的全局灵敏度方法对多参数复杂系统生物学模型分析的不足,采用Kriging代理模型法,结合改进的基于方差的Sobol法,建立采用代理模型法的Sobol定量全局灵敏度分析法,实现复杂模型参数灵敏度分析的快速定量化评估.选用基于Smad蛋白的TGF-β信号转导网络进行实例研究,以细胞核内磷酸化Smad复合物为目标函数评价模拟效果.研究表明,上述方法在实现定量全局灵敏度分析的同时降低了模型运行时耗,提高模型评估效率,且与传统Sobol法具有同样的评估效果.

关键词：代理模型、全局灵敏度、细胞信号转导网络

所属期刊栏目：32

分类号：TP391.9(计算技术、计算机技术)

资助基金：国家自然科学基金61304071

在线出版日期：2015-12-16（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共5页

页码：343-346,399