伤寒沙门菌非编码RNA AsfD的分子鉴定及表达特性

摘要：

目的:对伤寒沙门菌flhDC基因对侧编码的疑似非编码RNA AsfD进行分子鉴定及表达特性分析.方法:在AsfD已知序列区设计特异性引物,体外转录制备RNA探针,通过RNA印迹检测伤寒沙门菌AsfD的表达;使用cDNA末端快速扩增(5'rapid amplification of cDNA ends,RACE)和RT-PCR分析AsfD的转录起始位点和终止区域;用qRT-PCR检测AsfD在伤寒沙门菌不同生长时相和环境应激下的表达特性.结果:RNA印迹结果表明,伤寒沙门菌中确实存在AsfD表达,长度在2300 nt左右;5'RACE分析表明,AsfD转录起始点位于flhC基因终止密码子下游590 bp;RT-PCR结果表明其转录终止区域位于flhD基因起始密码子上游558~788 bp之间;序列分析显示AsfD全区域没有明显的ORF结构;qRT-PCR结果显示,AsfD在伤寒沙门菌生长的稳态期表达较高,酸、氧和高渗环境应激后均明显下降(P<0.01).结论:AsfD为伤寒沙门菌一长链非编码RNA,在不同时相和应激条件下存在表达调节.

关键词：伤寒沙门菌、非编码RNA、AsfD、环境应激

所属期刊栏目：28

分类号：R378.22(医学微生物学（病原细菌学、病原微生物学）)

资助基金：国家自然科学基金资助项目31670131

在线出版日期：2018-06-25（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共5页

页码：232-236