贵阳厌蚋全线粒体基因组及蚋科(双翅目:长角亚目)昆虫比较线粒体基因组分析

摘要：

为测定和分析贵阳厌蚋Simulium guiyangense Chen,Liu and Yang,2016 全线粒体基因组序列,明确蚋科昆虫的遗传多样性,探究其系统地位及蚋科昆虫内部的系统发育关系,本研究对贵阳厌蚋的线粒体基因组进行测序和注释,比较分析了已公布的蚋科昆虫线粒体基因组特征结构,并基于不同的数据集和方法对其系统发育关系进行了重建.结果显示,贵阳厌蚋线粒体基因组序列总长为 16491 bp(GenBank登录号:ON227412),共包含 13 个蛋白质编码基因(PCGs)、22 个tRNA基因、2 个rRNA基因和 1 个控制区.A、T、G、C碱基的含量分别为 37.63%、35.59%、11.18%、15.60%.除COI使用TTG作为起始密码子外,其余均以ATN作为起始密码子.除ND4 使用TAG作为终止密码子外,其余均采用TAA作为终止密码子.蚋科昆虫的蛋白质编码基因具有明显的AT偏向性,tRNASer(AGN)因缺少DHU臂均不能形成典型的三叶草结构,16S rRNA、12S rRNA 多数位点变异率为 0～25%.系统发育结果支持蛙蠓科 Corethrellidae 与蚊科Culicidae为姐妹群关系,奇蚋科Thaumaleidae和蚋科Simuliidae为姐妹群关系,蚋亚属Simulium为并系,与短蚋亚属Odagmia和厌蚋亚属Boophthora构成了布蚋亚属Byssodon的姐妹群.

关键词：蚋科、厌蚋亚属、贵阳厌蚋、线粒体基因组、系统发育

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分类号：Q969.44;S852.65;R384.2

资助基金：国家自然科学基金;国家自然科学基金;河北省自然科学基金;河北省教育厅科学技术研究项目;河北省引进留学回国人员项目;河北农业大学引进人才科研专项;河北农业大学大学生创新创业训练计划资助项目

在线出版日期：2023-08-25（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共13页

页码：103-115