细颈囊尾蚴四川和云南分离株线粒体nad1和cox1基因的序列测定与种系发育分析

摘要：

用PCR方法扩增分离自我国四川和云南2省5地山羊和猪共24个细颈囊尾蚴标本的线粒体烟酰胺腺嘌呤二核苷酸还原酶第1亚基(nad1)基因部分序列(pnad1)和细胞色素c氧化酶第Ⅰ亚基(cox1)基因全序列,分析其遗传变异,并用MEGA 4.0 程序NJ法和Bayesian 3.1程序贝叶斯推理法绘制种系发育树,探讨不同地区来源的细颈囊尾蚴种群间的遗传相似性及其他带科带属绦虫的亲缘关系.测序结果显示,细颈囊尾蚴的pnad1序列长度为780 bp,cox1基因全序列长度为1 620 bp.pnad1和cox1基因序列均存在一定的遗传变异,且pnad1序列的变异高于cox1基因序列.系统发育树显示,所有细颈囊尾蚴构成一个分支,可分为3个亚群,均未形成明显的地理分支或宿主分支.因此nad1基因是更适合于研究细颈囊尾蚴系统发生的遗传标记,同时两者在种内均相对保守,与其他带科绦虫种间差异较大,故均可用于细颈囊尾蚴的分子分类.

关键词：细颈囊尾蚴、nad1基因、cox1基因、遗传变异、种系发育

所属期刊栏目：19

分类号：S94;S85

资助基金：教育部《长江学者和创新团队发展计划》创新团队项目IRTO848

在线出版日期：2013-04-09（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共9页

页码：204-212