基于PNO基因序列分析隐孢子虫种系发育关系

摘要：

本文以核基因组的功能蛋白丙酮酸:NADP+氧化还原酶(pyruvate:NADP+ oxidoreductase,PNO)编码基因作为研究对象,对本实验室分离保存的隐孢子虫虫株进行扩增测序,用ClustalX 1.81对扩增序列与GenBank相关参考序列进行比对,用Paup4.0程序中邻接法(Neighbor-joining method,NJ)、最大简约法(Parsimonv,MP)和最大似然法(Maximum Likelihood,ML)进行聚类分析,以确定不同隐孢子虫分离株之间的遗传进化关系,并以18S rRNA和HSP70基因构僵的基因树作参照,进而评价PNO这一基因座是否适合作为隐孢子虫基因分型和进化关系分析的基因座.结果表明通过PNO构建的进化树将隐孢子虫分为2大类:Cryptosporidium bailey和C.meleagridis处于一个分枝,C.hominis、C.parvum牛基因型和C.parvum鼠基因型处于另一个分枝上.不同隐孢子虫之间的同源性介于95.0%～100%,能有效区分隐孢子虫不同基因型.因此,PNO基因序列也适合作为隐孢子虫分离株种系发育的遗传标记.

关键词：隐孢子虫、丙酮酸、NADP+氧化还原酶、基因分型、种系发育关系

所属期刊栏目：15

分类号：S85;S43

资助基金：河南省高校刨新人才培养工程项目豫教高[2004]294

在线出版日期：2008-09-01（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共6页

页码：20-25