红侧耳裂解多糖单加氧酶基因PdLPMO9B的克隆及生物信息学分析

摘要：

LPMO是一种含铜的裂解多糖单加氧酶,通过PCR技术扩增红侧耳CM13菌株PdLPMO9B基因cDNA序列,对其进行生物信息学分析,构建系统进化树.结果表明:成功克隆PdLPMO9B基因,其开放阅读框ORF长为744 bp,共编码247个氨基酸.编码蛋白的分子量为26.17 kDa,等电点为5.91,N端含有信号肽,疏水性较强.二级结构富含β-折叠和无规则卷曲,含有GH61家族结构域和纤维素结合模体CBM.三维建模显示,该基因与AA9家族成员最接近.系统进化树显示,红侧耳PdLPMO9B蛋白与糙皮侧耳(Pleurotus ostreatus)编码的GH61蛋白亲缘关系最近,聚为一类.

关键词：裂解多糖单加氧酶、生物信息学分析、红侧耳、基因克隆

所属期刊栏目：46

分类号：S646.14

资助基金：吉林省科技发展计划项目;吉林省教育厅项目

在线出版日期：2024-08-29（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共6页

页码：425-430