大豆抗逆相关基因GmERF10克隆及生物信息学分析

摘要：

为分离克隆大豆抗旱功能重要基因,前期运用RNA-Seq技术对M18苗期根系转录组进行了分析,筛选与苗期大豆根系生长发育相关的显著差异表达基因,选取差异较大的基因进行克隆,提取M18叶片基因组,设计引物,得到目标片段,命名为GmERF10.为了解GmERF10的结构和功能特点,利用生物信息学工具和软件对GmERF10的理化性质和蛋白质结构等进行了系统分析,并探讨了同物种及不同物种间乙烯应答转录因子(ERF)基因的亲缘关系.结果表明:GmERF10为不具有信号肽和跨膜结构域的亲水性蛋白.GmERF10含有38个潜在磷酸化位点.GmERF10蛋白的二级结构主要以α-螺旋、β-折叠和无规则卷曲组成.GmERF10亚细胞主要定位于细胞核中,结构域为AP2/ERF结构域,预测其功能为乙烯应答转录因子(ERF),主要通过结合GCC顺式作用元件来调节抗性基因的表达.

关键词：大豆;ERF;GmERF10;克隆;生物信息学;功能预测

所属期刊栏目：43

分类号：S565.1(经济作物)

资助基金：国家自然科学基金;国家自然科学基金

在线出版日期：2022-02-14（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共6页

页码：524-529