偏肿革裥菌C2H2型锌指基因表达分析

摘要：

C2H2型锌指转录因子在植物、动物和部分真菌的生长发育过程中发挥着重要的作用,但其在偏肿革裥菌(Lenzites gibbosa)中的作用尚不清楚.通过对木屑处理后不同时期的偏肿革裥菌菌丝进行提取和转录组分析,为偏肿革裥菌在营养基质条件下菌丝的生长研究提供支持.运用COG、GO和KEGG数据库进行注释分析,筛选出与偏肿革裥菌生长发育相关的C2H2型锌指基因,并对差异表达基因进行GO Pathway富集分析以及实时荧光定量PCR分析.COG注释分析表明,C2H2型锌指蛋白差异基因大部分与复制、重组和修复功能有关.GO富集分析表明,C2H2型锌指蛋白差异基因参与了细胞过程、细胞部分和结合功能.将差异基因比对到KEGG数据库中,共得到35条注释的序列,其中4条初生代谢通路得到注释,对其进行Pathway富集分析,发现差异基因显著富集于内质网蛋白加工通路中,表明偏肿革裥菌的生长发育与内质网蛋白加工通路密切相关.在木屑诱导下,随着木屑诱导时间的延长,9406基因相对表达量呈逐渐增长的趋势,11332、7835和5947基因相对表达量呈"先升后降"的趋势,11819和4346基因相对表达量呈"升-降-升"的趋势,3913和5738基因相对表达量呈"降-升-降"的趋势.此研究结果对偏肿革裥菌菌丝体生长研究具有重要的参考价值,为深入研究木质纤维降解关键基因的功能与作用机制奠定基础.

关键词：偏肿革裥菌、生长发育、转录组、C2H2型锌指基因

所属期刊栏目：43

分类号：S718.81(林业基础科学)

资助基金：黑龙江省自然科学基金;中央高校基本科研业务费专项

在线出版日期：2021-06-11（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共10页

页码：41-50