大白猪及巴马香猪GHRH基因的SNPs筛选及其与体尺的相关性分析
为了解影响猪生长和体尺的重要候选基因(GHRH基因)多态性与猪体尺的相关性,选取大白猪为大型猪的代表,巴马香猪为小型猪的代表,利用测序法筛查了两猪种间GHRH基因上存在的SNPs,统计了各个SNP在2个猪种的基因型频率及等位基因频率,然后基于基因型频率对每个SNP与猪体型的相关性进行分析,并将筛选到的与猪体型相关的SNPs进行连锁不平衡及单倍型分析.结果表明:共有7个SNPs存在于两猪种间,分别为g.1874A>C、g.2276A>G、g.4165 C>-、g.4238T>C、g.8079 I>-(GTGCTGGCGTGAG缺失)、g.8114 A>G及g.8178A>G,且这些SNPs均与猪体尺性状显著相关,其中g.2276A>G和g.4165 C>-存在连锁效应,并且大白猪形成的优势单倍型为AC,而巴马香猪为G-型,单倍型频率在两猪种间存在极显著差异(P<0.001);位于基因内含子4的3个位点(g.8079 I>-、g.8114 A>G及g.8178A>G)在大白猪中形成的单倍型为-GA,而巴马香猪为IAG,单倍型频率在两猪种间存在极显著差异(P<0.001).这说明猪GHRH基因上存在的SNPs与猪体尺相关,可作为猪种遗传性状及育种的筛选标记,将为提高养猪经济效益及猪育种提供理论依据.
GHRH基因、猪、体尺、单核苷酸多态性、连锁不平衡
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S828.2(家畜)
白城师范学院博士科研启动基金项目,国家自然科学基金项目31672514,31772699;吉林省科技发展计划项目20170101024JC;吉林省教育厅项目JJKH20190017KJ
2019-07-16（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
共6页
348-353
