西洋参bHLH转录因子家族生物信息学分析
bHLH是真核生物中一类编码转录调控因子的基因家族,在植物生长发育中具有重要的调控作用.通过对西洋参根、叶、花蕾样品进行转录组测序,筛选其中的bHLH家族基因,利用生物信息学方法对筛选到的基因进行表达模式、蛋白结构、细胞定位及系统进化分析.结果显示:从西洋参转录组中共鉴定得到62个西洋参bHLH家族基因,这些bHLH在根、叶、花蕾中具有4种表达模式.西洋参bHLH亚细胞定位预测主要在细胞核内,所有表达产物均包含HLH结构域.进化分析显示,西洋参中62个bHLH基因可分为18个亚类,其中第Ⅺ亚族中包含最多的bHLH成员,共包含11个bHLH蛋白;第Ⅲf、Ⅳa、Ⅲ(a+c)、Ⅰb(2)、Orphans、Ⅳb亚族中的成员数量均为1个,其他亚族为2~9个.
西洋参、bHLH基因家族、生物信息学方法、生物合成途径
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S567.53;Q78(经济作物)
吉林省自然科学基金项目20160520037JH;国家自然科学基金项目81703635
2019-07-16(万方平台首次上网日期,不代表论文的发表时间)
共8页
316-323