绿盲蝽多聚半乳糖醛酸酶基因的克隆及生物信息学分析
从绿盲蝽(Apolygus lucorum)成虫中克隆得到1个多聚半乳糖醛酸酶(Polygalacturonase,PG)基因AL-PG(GenBank登录号JQ288100.1),其碱基序列为1 050 bp,编码350个氨基酸.获得的该碱基序列与美国豆荚草盲蝽(Lygus hesperus)PG具有很高的同源性,碱基序列一致性为93%.该基因编码蛋白AL-PG有氨基端疏水信号肽序列(MKFTIYALGLLVAVASA).预测的成熟肽相对分子质量为35.9 kD,等电点为8.89.ALPG二级结构由大量的β-折叠、β-转角和无规则卷曲组成,而α-螺旋的数量非常少.AL-PG三级结构是右手平行的β螺旋结构,包含4组β折叠,PB1,PB2a,PB2b和PB3.催化氨基酸残基Asp153,Asp173和Asp174在底物结合裂缝的底部,底物结合裂缝入口的最小距离为8.4(A).
绿盲蝽、多聚半乳糖醛酸酶、基因克隆、生物信息学
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S763.35;Q785(森林保护学)
国家自然科学基金项目81102378
2014-09-22(万方平台首次上网日期,不代表论文的发表时间)
421-428