4个猪种IGF-1基因核心启动子区的克隆及生物信息学分析

摘要：

为了探索IGF-l基因的启动子结构特征对猪体长性状的影响,应用PCR方法从藏猪、巴马小型猪、野猪、军牧一号猪的基因组DNA中分别克隆测序了IGF-l基因启动子区序列,并结合生物信息学手段分析了不同品种猪之间启动子区转录因子结合位点数目和序列特征的差异,发现在IGF-l基因启动子区,巴马小型猪与藏猪、东北野猪、军牧一号猪相比,缺失CdxA、Nkx-2 2个转录因子结合位点,但比藏猪、东北野猪多了1个MZF1转录因子结合位点；藏猪、东北野猪与军牧一号猪相比,缺失1个MZF1转录因子结合位点,邻接法构建的分子进化树发现,藏猪与巴马小型猪亲缘关系最近,与东北野猪亲缘关系相对较近,但与军牧一号猪亲缘关系最远.结果表明:猪的IGF-l基因启动子结构在不同体长猪种上存在一定差异.

关键词：猪、IGF-1基因、启动子区、生物信息学

所属期刊栏目：35

分类号：S828;Q785(家畜)

资助基金：国家自然科学基金项目31101781,31072102;高等学校博士学科点专项科研基金项目20110061110081

在线出版日期：2013-12-05（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共4页

页码：587-590