东北民猪SLA-DQA基因的PCR-RFLP多态性分析

摘要：

采用克隆测序和PCR-RFLP的方法对SLA-DQA基因的整个编码区进行了扫描和多态性分析.结果表明该基因的第2外显子是整个基因的高变区,突变率达到5.6%,其中80%为有效突变,但没有发现新的等位基因;PCR-RFLP结果表明外显子2用限制酶EcoRⅠ酶切可获得3种基因型:254 bp(AA)、254 bp/88 bp/166 bp(AB)、88 bp/166 bp(BB),用限制酶Pvu Ⅱ酶切可获得3种基因型:254 bp(AA)、254 bp/129 bp/125 bp(AB)、129 bp/125 bp(BB),外显子3用限制酶FbaⅠ酶切可获得3种基因型:282 bp(AA)、282 bp/130 bp/152 bp(AB)、130 bp/152 bp(BB),外显子4用限制酶Hin1Ⅰ酶切可获得3种基因型:184 bp(AA)、184 bp/83 bp/101 bp(AB)、83 bp/101 bp(BB);Hardy-Weinberg平衡分析表明民猪在EcoRⅠ位点处于平衡状态(P＜0.05),而在PvuⅡ位点处于不平衡状态(P＞0.05),FbaⅠ和Hin1Ⅰ位点处于极不平衡状态(P＞0.01).

关键词：民猪、SLA-DQA、克隆、PCR-RFLP

所属期刊栏目：29

分类号：S828.2(家畜)

资助基金：黑龙江省杰出青年科学基金JC-05-19;黑龙江省科技攻关项目GB05B106

在线出版日期：2007-10-08（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共4页

页码：421-424