核18S rRNA 编码基因的多态性表明立枯丝核菌种复合体中菌丝融合群10区别于其他类群的遗传特性

摘要：

用11个限制性内切酶处理代表11个已报道的立枯丝核菌的菌丝融合群的25个种内类群的161个样品,来研究18S核rRNA的基因区的DNA多态性.该研究采用基于PCR的限制性图谱方法,即对酶催化的DNA扩增片段和亚片段用1个或2个限制性内切酶进行酶切.从这25个种内类群构建了4种类型的DNA限制性图谱,18S rDNA区段的图谱类型Ⅰ代表立枯丝核菌种内类型的大多数分离物,图谱类型Ⅱ和Ⅲ分别代表种内类群2E、9分离物和5C分离物,它们与图谱Ⅰ的区别在于图谱类型Ⅱ少一个限制性位点,图谱类型Ⅲ少2个位点.图谱类型Ⅳ代表种内类群10A和B(或者菌丝融合群10),该图谱表现出重要的限制性位点多样性,即与其余的种内类群或菌丝融合群相比,该区段具有5种酶切位点,在18 rRNA基因的25个限制性位点中有10个具有信息的位点,并被用来进行分析.以前报道的5.8S rRNA基因片段包括转录内间隔区在内的限制性图谱被用来和这些片段逐一对准,有12个具有信息的限制性位点被鉴定出来.这些数据被单独或混合用于研究类群的相互关系,通过最大相似性和似然法分析表明,菌丝融合群(AG)10明显与这个种复合物中的其他菌丝融合群的大多数分离物不同,且关系较远.

关键词：立枯丝核菌、菌丝融合群、18S rRNA、多态性

所属期刊栏目：24

分类号：Q949.331(植物学)

资助基金：Supported by the American Society for Microbiology

在线出版日期：2004-01-08（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共9页

页码：23-31