基于引力场算法的基因调控网络构建

摘要：

为了解决传统基因调控网络构建算法准确度不高且效率低下的问题,使用一种基于微分方程的新型网络构建算法.算法分为奇异值分解和引力场算法两部分,奇异值分解策略用来缩小解空间范围,提高运行效率.引力场算法是本文核心,共分初始化、解空间分解、移动算子和吸收算子4步骤.分解策略采用随机分组法,移动算子采用元素逐个移动法,并可根据收敛效果重新移动.最后,将本文算法与另两种启发式搜索算法下的网络构建进行比较,构建模拟和真实的基因调控网络.实验结果显示:本文算法具有更高的执行效率.

关键词：人工智能、引力场算法、基因调控网络、优化算法、奇异值分解

所属期刊栏目：44

分类号：TP18(自动化基础理论)

资助基金：国家自然科学基金项目60973092,60903097,61175023;吉林大学“985工程”项目;吉林大学研究生创新项目20121109

在线出版日期：2016-05-17（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共6页

页码：427-432