基于改进克隆选择算法的蛋白质关联图预测

摘要：

针对蛋白质关联图预测问题,提出一种克隆选择算法与蛋白质折叠规律相结合的预测方法,综合使用蛋白质序列疏水性质、残基的二级结构倾向、关联图总点数等信息,构造了基于限制规则的克隆选择算法适应度函数,设计了符合关联图生物学特性的变异操作.算法不需要使用额外蛋白质作为训练集,不需要从现有蛋白质数据库中提取模板,因此不受现有蛋白质结构数据的局限,可以由序列信息直接进行预测.对200个非同源蛋白质的测试验证了算法的有效性.

关键词：人工智能、蛋白质关联图、免疫算法、克隆选择算法、疏水性

所属期刊栏目：39

分类号：TP183(自动化基础理论)

资助基金："863"国家高技术研究发展计划项目2007AA04Z114;国家自然科学基金项目60673099,60873146

在线出版日期：2016-05-17（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共6页

页码：1303-1308